瓊脂糖凝膠電泳實驗之凝膠製作與點樣

 

1、瓊脂糖凝膠濃度

 

   配製凝膠的濃度據實驗需要而變 ，一般在0．8％ ～2．0％之間，如果一次配製凝膠100 ml，沒用完的凝膠可以再次融化，但隨著融化次數的增加，水分丟失也越多，凝膠濃度則會越來越高，導致實驗結果不穩定，補水辦法：一是在容器上標記煮膠前的刻度，煮膠後補充相應的水分至原刻度；二是在煮膠前稱重，煮膠後補充水至原重量。粗略一點的方法是通過多次較恒定的煮膠條件得出一個經驗補水值。以保證凝膠濃度基本維持在原濃度。核酸染色劑溴化乙錠(ethidium bromide)可加在融化的瓊脂糖中，終濃度為0．5 t*g／ml；也可在電泳結束後染色。

 

2、梳板的選用

 

   一般每個製膠模具均配有多個齒型不同的梳板，梳齒寬厚，形成的點樣孑L容積較大，用於DNA 片段回收實驗等；相反，梳齒窄而薄，形成的點樣孑L容積就較小，用於PCR產物、酶切產物鑒定等。梳板的選擇主要是看上樣量的多少而定，一般來說，上樣量小時盡量選擇薄的梳板製膠，此時電泳條帶致密清晰，便於結果分析。另外，每次製膠時都要注意梳齒與底板的距離至少要1 mm，否則，拔梳板時易損壞凝膠孑L底層，導致點樣後樣品滲漏。當然，點樣孑L的破壞還與拔梳板的時間和方法有關，一般凝膠需冷卻30 min以上方可拔梳板，應急的情況下可以將成型的凝膠塊放4℃ 冰箱中冷卻15 min 左右，拔梳板的方法是將製膠槽放置在電泳槽中的電泳緩衝液中，然後垂直向上慢慢用力，因為有液體的潤滑作用，梳板易拔出且不易損壞點樣孑L。

 

二、點樣

 

    點樣需加上樣緩衝液，因為上樣緩衝液中加了甘油或蔗糖增加密度，使樣品沉入孑L底；指示樣品的遷移過程，上樣緩衝液中一般加了兩種指示劑，溴酚蘭和二甲苯青(值得注意的是指示劑並非染色劑，DNA染色劑是溴化乙錠，而且要在紫外光的激發下才能看見桔紅色熒光)。上樣緩衝液儲存液一般為6× (10×)，表示其濃度為工作濃度的六倍。使用時上樣緩衝液應稀釋到一倍濃度。點樣方法是將移液器基本垂直點樣孑L，用另一隻手幫助固定移液器下端，移液器槍頭(Tip)進入點樣孑L即可將樣品注入孑L內，千萬不可將Tip尖插至孑L底，並點上適合的DNA分子量標準，所謂適合是指樣品DNA分子量大小應基本在DNA分子量標準範圍之內。